然而这时的明熹宗面对林御史的奏折，自然是听不进去的，毕竟还要依靠九千岁魏公公来打压东林党，以及充实国库税赋，因此便下旨将林汝翥廷杖后解职为民。

10月初3日，明司礼监掌印太监趁着皇帝陛下做木匠之际，矫旨责备明都察院左副都御史：杨涟，以「大不敬、无人臣礼」为由，直接将杨涟革职为民。

11月初8日，水西叛贼首领罗甸大王：安邦彦，领兵3万余人渡过三岔河南下，入安顺州进攻普定卫。

面对紧急军情明兵部右侍郎兼贵州总镇巡抚：蔡复一，急忙派遣明湖广川贵总理：鲁钦，等将领在汪家冲、蒋义寨处拦截水西叛贼大败之，明军又乘胜追击渡过三岔河直抵朵你则溪治所织金。

此时明贵州总镇巡抚：蔡复一，檄榜明湖广川贵总理：鲁钦、明贵州总镇总兵：黄钺，等将领分道御之。

之后明湖广提刑按察使兼赞画军前：尹伸，驻守普定卫击败来犯的水西叛贼，又与大军会合，吓得水西叛贼首领罗甸大王连忙逃遁渡河西奔。

后方的明湖广川贵总理、明贵州总镇总兵则督率诸将穷追不舍，明军还长驱直入织金，焚烧敌营数十里，获得牛马、甲仗无数。

明天启五年公元1625年正月11日，后金军发兵6千铁骑来势汹汹，开始反扑金州卫以及金州中左守御千户所的皮岛部明军，导致驻守在此沿海且兵力薄弱，又无后援的情况下，让明军节节败退！

在此的明金州卫游击将军：张盘、明金州卫千户：朱国昌，两位将领且战且退来到金州中左守御千户所沿海弹药打光，不幸殉国！

从此后金军又重新占领了金州卫地界，控制了辽南四卫地区的统治。

正月17日，明湖广川贵总理：鲁钦、明遵义军民府总兵：刘超，等将领从织金凯旋而归，却不料在渡河之际，反遭水西叛贼袭击，致使明军阵亡2千余人！

事后上奏报时，明贵州总镇巡抚：蔡复一，也因此遭到弹劾被罢免了官职。

3月初1日，朝廷经过商议后传旨让明贵州承宣布政使司左参政：王瑊，代为〈贵州总镇巡抚〉实际上仍由明兵部右侍郎：蔡复一，明贵州总镇巡按：傅宗龙，主持贵州都指挥使司军务。

他们决定采取沿河渡口置寨驻兵方案，就地屯田，彻底封锁水西叛贼的策略。

3月初8日，后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，出于战略目地考虑，决定以占领区内原大明帝国辽东都司府沈阳中卫，作为都城，摒弃辽阳卫迁都。

并在沈阳中卫原指挥所城内，修建了议政之所设有大政殿和十王亭，在中轴线北侧依照女真族建筑模式，建设一个居住之宫，史称罕王宫，这是为营建沈阳中卫故宫之开端。

在后金迁都沈阳中卫之后，还对统治境内的辽人展开了〈辽东之屠〉先屠谷尼堪、再杀富户、还诛贤人，致使辽人大面积反抗，以至于后金覆育英明天命汗几个月无心政事，更抽不开兵力对大明用兵。

3月11日，趁着东林党人游走奔波，去营救之前被关北镇抚司诏狱的明辽东总镇经略：熊廷弼，而让明中书舍人：汪文言，负责多方上奏祈求赦免。

怎奈此举惹怒了魏公公，他借此机会派出北镇抚司锦衣卫出动抓捕了明中书舍人下北镇抚司诏狱，并让明北镇抚司锦衣卫指挥佥事：许显纯，施以酷法拷讯。

其中魏公公还让明大理寺右寺丞：徐大化，去弹劾杨涟、明大理寺左寺丞：左光斗，宣称其；党同伐异，招权纳贿，并假借［汪文言之狱］企图谋害杨涟等人。

明北镇抚司锦衣卫指挥佥事在魏公公的授意下，开始对明中书舍人严刑逼供，要他诬陷杨涟受贿，可免他一死，但明中书舍人却宁死不屈，只能仰天大呼道“世岂有贪赃杨大洪哉。”

这样明北镇抚司锦衣卫指挥佥事无计可施，只好自己捏造供状，用来诬陷杨涟等人曾受明辽东总镇经略：熊廷弼，的贿赂二万两白银。

随即魏公公就光明正大的，派遣了北镇抚司锦衣卫缇骑与东厂锦衣卫配合，一同前去逮捕杨涟等人来京审讯。

然而在审问明中书舍人：汪文言，当中由于负责刑案画押的明北镇抚司锦衣卫指挥副使：刘侨，不愿意逼迫犯人，也不肯做此等勾当，便被魏公公给赶出了北镇抚司锦衣卫衙门。

一切审问事务均交由明北镇抚司锦衣卫指挥佥事处理。

5月初4日，明都察院江西道监察御史：田珍疏，上奏称“限禄一法，以万历四十八年见给之数禄银二十万六千两为额，根据各府宗室多寡均定，除亲王本人定额外，以现在人数为准，日后子孙增多，止在原额内均支，要在禄支不滥。”

明熹宗看后遂实行。