因此明兵科右给事中：周希令，建议要五百万两银子当做防御经费，而明兵科左给事中：沈应时，则建议筑起边城为山海卫的屏蔽。

双方经过商讨之后，群臣们核对估计动工需要工计费，至少为百万两银子，盖并造衙舍、筑铳台、建营房之费不计其数。

为此明辽东总镇经略还上奏称“臣尝谓必有复全辽之力量，而后可复广宁卫，必有灭奴之力量，而后可复全辽，不然启无巳之争，遗不了之局，而竭难继之供，不可不虑。”

他还发现山海卫关城内，本身就存在着重大的隐患，因此建议修重城，待重城修好以后，山海卫关城才能真正成为雄关天险，此举极具战略目光。

朝廷方面为了支持他的想法，自发内帘黄金20万两。

当时主要是关外五城（义州卫、广宁后屯卫、广宁中屯卫、广宁左屯卫、广宁左屯卫中左守御千户所）以及七十二堡皆为漠南蒙古诸部们所占据。

虽然声称是替大明帝国助守边，但是实际上则是行窥伺明军势力的举动，对此明辽东总镇经略：王在晋，与明蓟辽总督：王象乾，只会一意姑息，又请筑重关于八里铺。

不过他的主张，却遭到了明广宁前屯卫兵备道佥事：袁崇焕、明兵部主事：沈棨、明兵部司务厅司务：孙元化，等将领的反对。

其中以明广宁前屯卫兵备道佥事为主，要求修筑到二百里之外的宁远卫，但王总镇经略却不听从建议。

随后明广宁前屯卫兵备道佥事还两次，直接将意见报告给明内阁首辅，但明内阁首辅因不知前线的情况，拿不定主意。

这时明兵部右侍郎兼詹事府少詹事：孙承宗，自请上奏要亲身前往山海卫关外勘察地形，而由于孙侍郎乃是帝师，所以明熹宗不太舍得让他离开。

但为了稳定朝中局势，还是忍痛割爱让帝师出关勘察。

3月25日，明兵部右侍郎：孙承宗，巡视回朝后建议出关筑守宁远卫要害，与觉华岛形成相犄角，后又面奏明熹宗，称；王总镇经略不太懂军务、不堪胜任，当自请督师。

这让明熹宗大喜，不得不派出帝师总督军务了，便特加明兵部右侍郎：孙承宗，为〈太子太保兼辽东总镇经略〉并赐蟒袍玉带、银币，以示隆礼。

3月27日，朝廷传令贵州承宣布政使司附近各镇派遣精兵应援，并调遣了湖广都指挥使司、云南都指挥使司、广西都指挥使司，这三镇都司4万明军入贵州承宣布政使司救援。

4月11日，李氏朝鲜兵曹判书：申景禛，以吊唁李氏朝鲜平山府使：李贵，出家为尼的女儿：李礼顺，的名义前去拜访李氏朝鲜平山府使，以阐明举事之意，得到赞同。

于是李氏朝鲜平山府使之子李氏朝鲜延阳府院君：李时白、李氏朝鲜汉城府参军：李时昉、李氏朝鲜汉城府儒生：金自点、李氏朝鲜加平郡儒生：沈器远、前任李氏朝鲜兵曹佐郎：崔鸣吉，等人都相继加入到政变集团中，此后预谋效力者较多。

4月14日，明礼部尚书：孙慎行，上疏追论红丸案事件，并弹劾先帝光宗泰昌朝时期的明内阁首辅：方从哲，有包庇明鸿胪寺寺丞：李可灼，的行为？

为此明熹宗下令廷臣商议，参与议论者达一百一十多人，纷纷声讨方阁老有罪，唯独明刑部尚书：黄克缵，及明礼科给事中：汪庆百，等数人为其袒护。

由于事情复杂且有人求情，因此重审此案，以免冤枉忠臣，也能断了流言蜚语。

后来为了平息争论明熹宗宣布废除李可灼官职遣去戍边，明御药房太监：崔文升，则被发配到南直隶应天府南京城皇城打扫卫生，而对于在府宅修养的废臣：方从哲，暂不处理。