怎奈不明情况的李氏朝鲜尚庆左道兵马节度使：金应瑞，就直接上报给李氏朝鲜都元帅：权栗，而李氏朝鲜都元帅又上报李氏朝鲜宣祖昭敬郡王河城大君：李昖，使得李氏朝鲜郡王当即就命令李氏朝鲜三道水军统制使：李舜臣，准备迎敌。

但他却怀疑其中有诈，一直徘徊不出。

10月22日，明神宗：朱翊钧，派大批宦官为税使，到各地征税，专供内廷挥霍之用，先命明御马监左监丞：张烨，前往北直隶顺天府通州右卫张家湾征收租税，给以关防，规定每年征取白银四千两，分为四季并且按季解进。

不久又命明神宫监管理太监：王朝督，征天津卫、天津左卫、天津右卫，从此与矿监之祸并为榨取民膏民脂的税法之祸由此开始。

自是二三年间税使四出，多兼领矿，许多人集矿监、税使一身，到处横行勒索，贪奸无比，民益不堪怨声载道，群臣分分屡谏，但明神宗却无动于衷。

明万历二十五年公元1597年正月12日，幕府太政大臣：丰臣秀吉，在弄清楚事情的来龙去脉之后，以李氏朝鲜王子不来谢罪为借口宣告（明、幕）和谈破裂！

正月13日，幕府太政大臣就发动了第二次对朝战争。

这次派遣了幕府第一军熊本国藩主兼左副将：加藤清正，率领1万人、幕府第二军从五位下摄津守兼右副将：小西行长，率领1万4千人、幕府第三军福冈国藩主兼甲斐守：黑田长政，率领1万人、幕府第四军加贺守：锅岛直茂，率领1万2千人、幕府第五军下参议：岛津义弘，率领1万人、幕府第六军土佐守：长宗我部元亲，率领1万3千人、幕府第七军阿波守：蜂须贺家政，率领1万1千人、幕府第八军右军大将：毛利秀元，率领4万人。

以上倭军人数总共十二万，在加上驻守在尚庆左道釜山浦的预备队，倭军总兵力约为十四万人。

另有水军指挥官幕府第一军水师佐渡守：藤堂高虎，率领2800人、幕府第二军水师左马助：加藤嘉明，率领2400人、幕府第三军水师中务少辅：胁坂安治，率领1200人、幕府第四军水师河野家督：来岛通总，率领600人、幕府第五军水师长宗部队长：菅平右卫门达长，率领200人。

此次倭军一起出动了陆军人，水师7200人，水陆并进再度入侵李氏朝鲜王国，史称［丁酉倭乱］。

正月21日，李氏朝鲜都元帅至尚庆右道闲山岛，对李氏朝鲜三道水军统制使说道“朝鲜语；加藤清正马上就要来了，水师要按照时罗的约定出动，千万不要错过战机！”

但在李氏朝鲜都元帅返回后的第二天，李氏朝鲜郡王就得知幕府第一军左副将：加藤清正，已于正月15日抵达李氏朝鲜王国尚庆右道长门浦。

这让李氏朝鲜郡王震怒，他召群臣骂道“朝鲜语：倭酋（小西行长）如示诸掌而指教之，我国不能为之，我国诚天下庸劣国也！今者舜臣岂望擒馘清正之首哉？只扬舲耀武，沿洄洋路，而终不得为，诚可叹也！”

同时认为李氏朝鲜三道水军统制使长期惯于欺君，武臣轻慢朝廷之习，不可不治，所以决定严惩李舜臣。

正月25日，李氏朝鲜郡王遣使向大明帝国求援。

2月初5日，大明朝廷遂召集各官议论李氏朝鲜王国的战局形势，并分析了倭军的动向，到了2月11日朝廷再议援朝事宜，决定调遣万全都指挥使司宣府镇、山西行都指挥使司大同府和北直隶蓟州镇、辽东都指挥使司的军队七千人，还招募了浙兵三千七百人，并诏令李氏朝鲜王国设立海防司道官。

2月11日，李氏朝鲜三道水军统制使：李舜臣，被扣上了「欺罔朝廷、纵贼不讨」之罪下狱，取而代之的是李氏尚庆右道水军节度使：元均，统制三军。

2月15日，明神宗开始任命原明延绥总镇总兵兼都督同知：麻贵，为「备倭总兵」统帅南北诸军出师李氏朝鲜王国，征剿幕府侵略军。

3月15日，明神宗升明山东布政司右参政：杨镐，为「都察院右佥都御史」经略李氏朝鲜王国军务，为了加强后援，支持明都察院右佥都御史：杨镐，经理李氏朝鲜王国的军务。

紧接着又命明兵部左侍郎：邢玠，为［兵部尚书兼右副都御史］总督蓟州镇、辽东都指挥使司、保定府大宁都指挥使司的军务兼理粮饷，并且经略御倭。

然而明都察院右佥都御史还未至，就先上奏十事，其中有令李氏朝鲜王国官民输粟，得增秩、授官、赎罪，以及乡吏丁夫等免役。

又以李氏朝鲜王国君臣隐匿钱粮，不饷援朝明军，劾奏其罪，因此李氏朝鲜王国官民们多怨杨御史。

这时李舜臣在狱中遭到严刑拷打，可能有性命之忧！

为此李氏朝鲜知中枢府事：郑琢，就上了一道《伸救箚》历数李舜臣的功劳，为李舜臣辩护，还请求李氏朝鲜郡王开恩特赦。

才让李氏朝鲜郡王同意免李舜臣一死，并让他再度白衣从军，时为明万历二十五年公元1597年、宣祖三十年4月初1日，但是此前李舜臣的老母：卞氏，便得知了李舜臣入狱，忧虑成疾不久逝世。