荒木村重虽然没有待在本丸的两层天守之中，但对上杉军所拥有的新式武器惊恐万分。在意识到自己已是穷途末路之后，荒木村重就不再坚持抵抗，于当天傍晚率家中重臣中川清秀、高山友照、有间出羽守等人开城向上杉军投降了。

由于摄津一国的战事尚未完全结束，在外有别所家不断袭扰，在内还有石山御坊尚未攻落。故而，景定决定对荒木村重进行宽大处置，留他一命，让其剃发出家，拜入千利休门下，成为一名茶人，不再拥有武士的身份。至于荒木村重的家卷、族人，景定就不打算继续追究了，仅仅只是将其长子荒木村次发配至丹波守护细川藤孝麾下效力，其余人等尽皆大赦。

虽说景定饶荒木村重一命，但并不代表就忘记中川清秀、高山友照、有间出羽守、池田丰后守、池田周防守等暗杀池田胜正、和田惟政二人，以及与一向一揆军联手夹击上杉军，导致高田为业、有马则赖、鸟养贞长、长尾筑后守等己方诸将先后被讨取。

像这样的首恶之人，就算景定想放过，上杉景信、和田惟长、池田直正等己方诸将也是不会轻易同意的。

最后，景定在上杉军完全控制加茂城内外，就立即下令将中川清秀、高山友照、有间出羽守、池田丰后守、池田周防守等首恶之人擒拿，并押至京都六条河畔斩首示众。而他们的家卷则是尽数流放至陆奥北郡。

此时还在坚守池田城的池田知正和池田光重二人在得知荒木村重开城投降的消息皆震惊不已，他们自知无法得到上杉将军家的赦免，就立即弃城而逃。

就这样，上杉将军家压制了除石山御坊周边以外的摄津一国绝大部分地区。

鉴于大环境如此，

永禄十二年，十月末。

几乎一夜之间，延历寺山门三塔十六谷二别所全部的僧人在醒来后发觉，整个坂本周边满是飘扬的“退者无间地狱，进者往生极乐”旗、三盛龟甲纹旗等，琵琶湖上大大小小的舟船穿梭如织，水陆两面六万余大军如急雨乌云般将山门四面八方团团围定。

正值秋季，志贺群山一片好看的深红，凉风阵阵，同时还将一丝恐慌不安吹入了僧人的心中，抬头望去是盘旋而自由的飞鸟，但飞鸟所落下的羽毛下，偌大的延历寺已化为一片死域。

坂本、竖田周边不论是老弱妇孺还是青壮，皆哭喊着被浅井·一向一揆军所驱赶着，如同惊弓之鸟一般逃入山门寻求延历寺的庇护。

而在比睿山下四处放火的浅井·一向一揆联军上下则是面色冷峻，犹如地狱里面的恶犬一般。